La génomique fait progresser de plus en plus le développement de l’élevage

L’avenir de l’industrie de l’élevage bovin dans l’Ouest canadien sera la génomique, déclare John Basarab, chercheur scientifique à l’Université de l’Alberta et chef des opérations bovines chez Livestock Gentec.

« Nos bovins dans l’ouest du Canada et en Alberta sont très bien adaptés à leur environnement et à leur système de production », a déclaré Basarab. « Ils sont durables; ils ont résisté à l’épreuve du temps à travers de nombreux défis économiques et environnementaux.

« En disant cela, cela ne signifie pas que vous ne pouvez pas vous améliorer davantage. C’est ce que nous essayons de faire – trouver des tests génomiques et des outils qui aident les éleveurs de bovins à produire des bovins plus rentables et plus durables.

Livestock Gentec est un Alberta Innovates Centre basé à l’Université de l’Alberta. Il a été créé en 2010 pour apporter les avantages commerciaux de la génomique à l’industrie canadienne de l’élevage.

« Il rassemble essentiellement des chercheurs scientifiques d’Agriculture et Agroalimentaire Canada par l’intermédiaire de l’Université de l’Alberta, et d’autres à l’échelle nationale et internationale », a expliqué Basarab. « Cela fonctionne sur des solutions génomiques aux problèmes de l’industrie de l’élevage. »

Au cours des 12 dernières années, Livestock Gentec a également travaillé en étroite collaboration avec le Ranch de recherche Roy Berg Kinsella et le Centre de recherche et de développement de Lacombe pour développer une base de données ADN complète comprenant plus de 13 000 bovins de boucherie de race pure et de race croisée en Alberta – agissant presque comme un Ancestry.com pour l’industrie bovine de l’Alberta.

L’accès à toutes ces données génomiques a permis à Livestock Gentec de développer un test ADN disponible dans le commerce appelé Envigor HX, qui est licencié à Neogen Canada.

Avec un seul test ADN, a expliqué Basarab, un éleveur de bétail peut désormais savoir très rapidement si un animal sera probablement un aliment efficace, à quel taux de croissance s’attendre, le poids au sevrage probable et divers autres facteurs qui contribuent tous à la rentabilité des producteurs de viande bovine et qualité des produits pour l’industrie canadienne de l’emballage de la viande.

Le test disponible dans le commerce est précis à environ 40-45%, ce qui est bon pour un test génétique, a déclaré Basarab.

« Cela équivaut essentiellement à avoir 10 ou 12 enregistrements de progéniture », a-t-il expliqué. « Vous pouvez imaginer le coût et le temps qu’il vous faudrait pour obtenir 12 enregistrements de descendance pour l’ingestion d’aliments… Cela serait très coûteux et prendrait beaucoup de temps. Notre base de données permet essentiellement à un producteur de prélever un échantillon de poils ou de tissus et d’obtenir ces valeurs d’élevage immédiatement sur tous les traits.

Bien que les résultats semblent utiles pour prendre des décisions en matière de gestion du bétail au niveau de la ferme, en particulier lorsqu’il s’agit de décider quels taureaux utiliser comme taureaux ou quelles jeunes génisses garder pour les troupeaux de remplacement, Basarab a déclaré que l’industrie canadienne des bovins de boucherie était à la traîne. d’autres industries de l’élevage dans son utilisation des tests génétiques.

Selon Basarab, alors que les industries canadiennes des bovins laitiers et du porc ont adopté la génomique pour aider à prendre des décisions de gestion depuis près de 20 ans, les producteurs de bœuf commencent tout juste à envisager une utilisation plus répandue des tests génétiques.

« Mais maintenant, cela devient une chose beaucoup plus importante », a-t-il confirmé. « Juste à titre d’exemple, au cours de l’année dernière, nous avons collecté plus de (que) 10 000 échantillons d’ADN auprès de producteurs de viande bovine. Nous les avons fait génotyper et leur avons produit des valeurs génétiques moléculaires. Vous pouvez donc voir que les producteurs investissent du temps et de l’argent dans la collecte de tous ces échantillons d’ADN. C’est une assez bonne indication que les choses vont commencer à croître de façon exponentielle dans l’industrie du boeuf.

Avant cette explosion d’activités de tests génomiques locaux en 2021-2022, Basarab affirme que la plupart des tests effectués par Neogen Canada à l’aide du test ADN multi-traits de Livestock Gentec en Alberta provenaient en grande partie des associations d’élevage de bovins de race pure de manière extrêmement limitée. – en d’autres termes, « presque nul », a-t-il déclaré.

Cet afflux de tests est un nouveau développement passionnant après des années de recherche génomique sur les bovins en Alberta, a déclaré Basarab, et il pense que le ciel est vraiment la limite quant à l’avenir de ce type de tests génomiques dans l’industrie des bovins de boucherie. La prochaine frontière pour Livestock Gentec, dit-il, est les progrès des tests génomiques pour aider les éleveurs de bovins à réduire les émissions de gaz à effet de serre de leurs troupeaux et à réduire leur empreinte carbone.

Jusqu’à présent, la plupart des dollars de recherche sur ce front ont été consacrés à des interventions nutritionnelles et de gestion. Basarab a souligné que l’efficacité alimentaire chez les animaux est certainement un trait héréditaire sur lequel les tests génomiques actuels peuvent fournir des informations. Mais, a-t-il dit, que se passerait-il si des installations de recherche comme la sienne, en partenariat avec l’industrie de l’élevage bovin, pouvaient compiler une base de données d’animaux qui révèle réellement la quantité de méthane qu’ils produisent par vache ?

Selon Basarab, avec une base de données comme celle-ci, composée d’un échantillon de taille suffisante, les futurs tests génétiques pourraient révéler quels animaux produisent réellement moins de méthane dans leur corps et aider les agriculteurs à sélectionner des reproducteurs parmi ces animaux.

« Nous pourrions développer une valeur d’élevage pour les émissions de méthane », a-t-il déclaré. « Cependant, à ce stade, nous ne l’avons pas encore fait… J’ai mesuré les émissions de méthane et les émissions de CO2 de centaines de bovins. Nous savons donc comment faire. Cependant, c’est une technologie très coûteuse.

Basarab a déclaré qu’il faudrait beaucoup de coopération de la part de l’industrie bovine pour tester les dizaines de milliers d’animaux nécessaires à la création d’une telle base de données, et un investissement soutenu et important dans la recherche pour la financer.

« Cela nécessite des investissements, et l’industrie, la société et le gouvernement doivent être intéressés à investir », a-t-il déclaré.